La temperatura massima a Upernavik è in media -5°C durante l'anno, con valori generalmente compresi tra -17°C a febbraio e 6°C ad agosto. Le piogge restano limitate, con circa 477 mm di precipitazioni all'anno. Il mese più secco riceve 15 mm a febbraio, rispetto a 71 mm ad agosto per il più piovoso.
Il clima è quindi abbastanza sfavorevole per tutto l'anno per un viaggio a Upernavik.
Per osservare l'aurora boreale nelle migliori condizioni, i mesi migliori sono gennaio, febbraio, novembre e dicembre.
Per quanto riguarda l'affluenza, i periodi più tranquilli sono in gennaio, febbraio, maggio e novembre, mentre l'affluenza è elevata in settembre, luglio e agosto.